Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC9P31274 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC9P31274 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms