Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms