Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YY1P25490 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YY1P25490 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YY1P25490 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YY1P25490 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YY1P25490 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YY1P25490 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YY1P25490 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YY1P25490 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YY1P25490 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YY1P25490 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YY1P25490 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms