Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIG1P18858 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIG1P18858 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIG1P18858 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms