Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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