Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms