Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms