Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFTRP13569 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CFTRP13569 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CFTRP13569 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CFTRP13569 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CFTRP13569 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFTRP13569 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFTRP13569 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFTRP13569 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFTRP13569 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFTRP13569 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFTRP13569 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFTRP13569 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFTRP13569 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFTRP13569 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFTRP13569 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFTRP13569 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFTRP13569 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFTRP13569 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFTRP13569 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFTRP13569 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFTRP13569 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFTRP13569 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFTRP13569 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFTRP13569 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFTRP13569 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CFTRP13569 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFTRP13569 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFTRP13569 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFTRP13569 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFTRP13569 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFTRP13569 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFTRP13569 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFTRP13569 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFTRP13569 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFTRP13569 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CFTRP13569 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFTRP13569 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFTRP13569 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFTRP13569 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFTRP13569 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFTRP13569 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFTRP13569 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CFTRP13569 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFTRP13569 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CFTRP13569 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CFTRP13569 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFTRP13569 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFTRP13569 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFTRP13569 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFTRP13569 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFTRP13569 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFTRP13569 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFTRP13569 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFTRP13569 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFTRP13569 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFTRP13569 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFTRP13569 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFTRP13569 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFTRP13569 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFTRP13569 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms