Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYL1P12980 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYL1P12980 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYL1P12980 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms