Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms