Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms