Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD1P0DJD0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms