Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRPRAP08240 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRPRAP08240 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRPRAP08240 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRPRAP08240 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRPRAP08240 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SRPRAP08240 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRPRAP08240 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRPRAP08240 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRPRAP08240 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SRPRAP08240 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms