Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms