Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX58O95786 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX58O95786 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX58O95786 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX58O95786 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX58O95786 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX58O95786 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX58O95786 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX58O95786 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX58O95786 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX58O95786 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX58O95786 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX58O95786 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX58O95786 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX58O95786 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms