Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms