Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPO95166 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPO95166 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPO95166 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPO95166 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPO95166 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPO95166 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPO95166 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPO95166 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPO95166 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPO95166 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPO95166 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms