Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM2O94769 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ECM2O94769 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM2O94769 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM2O94769 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms