Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLOT1O75955 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms