Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms