Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPHP4O75161 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP4O75161 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms