Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUBNO60494 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUBNO60494 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUBNO60494 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms