Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms