Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms