Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms