Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APAF1O14727 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
APAF1O14727 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
APAF1O14727 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APAF1O14727 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
APAF1O14727 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APAF1O14727 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APAF1O14727 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APAF1O14727 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms