Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIEO00221 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms