Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF180Q9UJW8 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms