Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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SH3BP4Q9P0V3 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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