Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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