Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HLA-CQ95604 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms