Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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SYCP1Q15431 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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SYCP1Q15431 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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SYCP1Q15431 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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SYCP1Q15431 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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SYCP1Q15431 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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SYCP1Q15431 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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SYCP1Q15431 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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