Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms