Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
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