Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms