Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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UBXN4Q92575 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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UBXN4Q92575 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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UBXN4Q92575 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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UBXN4Q92575 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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UBXN4Q92575 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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