Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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