Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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