Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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TRIP13Q15645 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRIP13Q15645 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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TRIP13Q15645 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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TRIP13Q15645 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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TRIP13Q15645 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIP13Q15645 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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