Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms