Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CUL3Q13618 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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