Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 SERPINA10-201ENST00000261994 4978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 PLS1-202ENST00000457734 3706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 STRADA-230ENST00000638702 2140 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 TSGA10-203ENST00000393483 3878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 CLIP1-218ENST00000545889 4633 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 ATP1A2-202ENST00000392233 3338 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 CELF2-205ENST00000542579 7982 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 ABI1-208ENST00000376160 3515 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 MPPE1P1-201ENST00000557286 1076 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 AL118508.2-201ENST00000622708 673 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 AC024132.1-201ENST00000382007 2509 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 AC016526.3-201ENST00000624275 3931 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 STAT1-204ENST00000409465 3097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 GALK2-203ENST00000544523 1950 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
HOXD11P31277 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 TTLL5-221ENST00000557636 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 ZNF80-203ENST00000619534 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 ZNF322-207ENST00000607204 4737 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 LINC00402-201ENST00000419499 3340 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 ADGRF4-201ENST00000283303 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 SAG-201ENST00000409110 1591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 AL450468.1-201ENST00000415166 450 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 Z82173.1-201ENST00000453924 484 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 AC108865.1-201ENST00000507644 496 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 TULP3-201ENST00000397132 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 ASH2L-202ENST00000428278 2678 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 AKAP2-202ENST00000374525 6866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 UACA-203ENST00000539319 4026 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 MED23-205ENST00000368068 5233 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 KCTD16-202ENST00000512467 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 RSPH4A-203ENST00000368581 2704 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 SNX20-203ENST00000423026 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 NRP1-207ENST00000374875 5407 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
HOXD11P31277 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
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