Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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HOXA2O43364 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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HOXA2O43364 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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HOXA2O43364 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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HOXA2O43364 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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HOXA2O43364 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HOXA2O43364 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HOXA2O43364 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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