Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms