Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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