Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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BBS9Q3SYG4 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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