Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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SMCO1Q147U7 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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SMCO1Q147U7 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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