Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms