Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 AC008619.1-201ENST00000524312 567 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MSH5O43196 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 AC244157.1-201ENST00000415642 163 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 AC087379.2-201ENST00000532242 471 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MSH5O43196 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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MSH5O43196 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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MSH5O43196 TTLL7-IT1-201ENST00000455929 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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MSH5O43196 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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MSH5O43196 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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MSH5O43196 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 AC104046.1-201ENST00000559487 406 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 AC016876.3-201ENST00000610459 426 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MSH5O43196 AC131159.2-201ENST00000613236 702 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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