Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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LINC00587B1AMM8 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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LINC00587B1AMM8 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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LINC00587B1AMM8 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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LINC00587B1AMM8 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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LINC00587B1AMM8 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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LINC00587B1AMM8 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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LINC00587B1AMM8 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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LINC00587B1AMM8 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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LINC00587B1AMM8 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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